MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 chromosome

Total Repeats: 37401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008530	ATA	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628684
2	NC_008530	GGA	2	6	120	125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628684
3	NC_008530	T	7	7	127	133	0 %	100 %	0 %	0 %	116628684
4	NC_008530	A	7	7	177	183	100 %	0 %	0 %	0 %	116628684
5	NC_008530	TAA	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628684
6	NC_008530	AAG	2	6	385	390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628684
7	NC_008530	AGTA	2	8	489	496	50 %	25 %	25 %	0 %	116628684
8	NC_008530	AGC	2	6	536	541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628684
9	NC_008530	TTTA	2	8	590	597	25 %	75 %	0 %	0 %	116628684
10	NC_008530	TGG	2	6	602	607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628684
11	NC_008530	TTA	2	6	718	723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628684
12	NC_008530	A	6	6	731	736	100 %	0 %	0 %	0 %	116628684
13	NC_008530	TAA	2	6	758	763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628684
14	NC_008530	TAG	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628684
15	NC_008530	TTC	2	6	804	809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628684
16	NC_008530	A	6	6	813	818	100 %	0 %	0 %	0 %	116628684
17	NC_008530	A	6	6	1011	1016	100 %	0 %	0 %	0 %	116628684
18	NC_008530	TGA	2	6	1040	1045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628684
19	NC_008530	CAA	2	6	1129	1134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628684
20	NC_008530	AAG	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628684
21	NC_008530	A	7	7	1198	1204	100 %	0 %	0 %	0 %	116628684
22	NC_008530	AAG	2	6	1231	1236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628684
23	NC_008530	GAAA	2	8	1279	1286	75 %	0 %	25 %	0 %	116628684
24	NC_008530	TTG	2	6	1300	1305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628684
25	NC_008530	TGG	2	6	1379	1384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628684
26	NC_008530	ATGC	2	8	1404	1411	25 %	25 %	25 %	25 %	116628684
27	NC_008530	AGC	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628684
28	NC_008530	TAATG	2	10	1725	1734	40 %	40 %	20 %	0 %	116628685
29	NC_008530	TTC	2	6	1743	1748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628685
30	NC_008530	TGA	2	6	1794	1799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628685
31	NC_008530	TCGA	2	8	1834	1841	25 %	25 %	25 %	25 %	116628685
32	NC_008530	GAT	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628685
33	NC_008530	GTT	2	6	1870	1875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628685
34	NC_008530	T	6	6	1909	1914	0 %	100 %	0 %	0 %	116628685
35	NC_008530	A	6	6	1927	1932	100 %	0 %	0 %	0 %	116628685
36	NC_008530	ATT	2	6	2101	2106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628685
37	NC_008530	GTC	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628685
38	NC_008530	TAA	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628685
39	NC_008530	TCA	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628685
40	NC_008530	TAA	2	6	2270	2275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628685
41	NC_008530	TAG	2	6	2291	2296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628685
42	NC_008530	ATT	2	6	2308	2313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628685
43	NC_008530	CTA	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628685
44	NC_008530	TCT	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628685
45	NC_008530	GTA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628685
46	NC_008530	GAA	3	9	2608	2616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628685
47	NC_008530	AAG	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628685
48	NC_008530	AG	3	6	2677	2682	50 %	0 %	50 %	0 %	116628685
49	NC_008530	GC	3	6	2688	2693	0 %	0 %	50 %	50 %	116628685
50	NC_008530	ATT	2	6	2710	2715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628685
51	NC_008530	TCT	2	6	3095	3100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628686
52	NC_008530	GGT	2	6	3101	3106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628686
53	NC_008530	GTTAA	2	10	3137	3146	40 %	40 %	20 %	0 %	116628686
54	NC_008530	TCG	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628686
55	NC_008530	GAAA	2	8	3171	3178	75 %	0 %	25 %	0 %	116628686
56	NC_008530	TTGAA	2	10	3258	3267	40 %	40 %	20 %	0 %	116628687
57	NC_008530	ATTT	2	8	3368	3375	25 %	75 %	0 %	0 %	116628687
58	NC_008530	T	6	6	3373	3378	0 %	100 %	0 %	0 %	116628687
59	NC_008530	AATT	2	8	3417	3424	50 %	50 %	0 %	0 %	116628687
60	NC_008530	A	6	6	3514	3519	100 %	0 %	0 %	0 %	116628687
61	NC_008530	AAG	2	6	3545	3550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628687
62	NC_008530	AATG	2	8	3571	3578	50 %	25 %	25 %	0 %	116628687
63	NC_008530	AGA	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628687
64	NC_008530	ATT	2	6	3726	3731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628687
65	NC_008530	A	6	6	3749	3754	100 %	0 %	0 %	0 %	116628687
66	NC_008530	T	7	7	3768	3774	0 %	100 %	0 %	0 %	116628687
67	NC_008530	GCA	2	6	3806	3811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628687
68	NC_008530	ATA	2	6	3815	3820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628687
69	NC_008530	GAA	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628687
70	NC_008530	A	6	6	3842	3847	100 %	0 %	0 %	0 %	116628687
71	NC_008530	GCT	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628687
72	NC_008530	T	6	6	3909	3914	0 %	100 %	0 %	0 %	116628687
73	NC_008530	TTA	2	6	3975	3980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628687
74	NC_008530	ACT	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628687
75	NC_008530	TAAT	2	8	4062	4069	50 %	50 %	0 %	0 %	116628687
76	NC_008530	A	7	7	4071	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	116628687
77	NC_008530	TTA	2	6	4184	4189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628687
78	NC_008530	GAT	2	6	4190	4195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628687
79	NC_008530	TGA	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628687
80	NC_008530	ATC	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628687
81	NC_008530	AAC	2	6	4270	4275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628687
82	NC_008530	CTG	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628687
83	NC_008530	AGA	2	6	4372	4377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628688
84	NC_008530	GCA	2	6	4388	4393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628688
85	NC_008530	TAAA	2	8	4395	4402	75 %	25 %	0 %	0 %	116628688
86	NC_008530	GTAT	2	8	4491	4498	25 %	50 %	25 %	0 %	116628688
87	NC_008530	TAG	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628688
88	NC_008530	ACC	2	6	4527	4532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628688
89	NC_008530	ATT	2	6	4544	4549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628688
90	NC_008530	ATA	2	6	4551	4556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628688
91	NC_008530	TGA	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628688
92	NC_008530	GTC	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628688
93	NC_008530	GGT	2	6	4718	4723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628688
94	NC_008530	CGG	2	6	4729	4734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116628688
95	NC_008530	TGG	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628688
96	NC_008530	GTA	2	6	4781	4786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628688
97	NC_008530	GA	3	6	4822	4827	50 %	0 %	50 %	0 %	116628688
98	NC_008530	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628688
99	NC_008530	GAA	2	6	4904	4909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628688
100	NC_008530	GAC	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628688
101	NC_008530	AAAG	2	8	5051	5058	75 %	0 %	25 %	0 %	116628688
102	NC_008530	AAG	2	6	5127	5132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628688
103	NC_008530	TGA	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628688
104	NC_008530	AAC	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628688
105	NC_008530	AAGGAC	2	12	5339	5350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116628688
106	NC_008530	TGT	2	6	5392	5397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628688
107	NC_008530	CTT	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628688
108	NC_008530	TTG	2	6	5541	5546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628688
109	NC_008530	CTG	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628688
110	NC_008530	AAG	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628688
111	NC_008530	ACA	2	6	5655	5660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628688
112	NC_008530	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628688
113	NC_008530	ATT	2	6	5906	5911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628688
114	NC_008530	CT	3	6	5961	5966	0 %	50 %	0 %	50 %	116628688
115	NC_008530	GTT	2	6	6122	6127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628688
116	NC_008530	TCG	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628688
117	NC_008530	TAGA	2	8	6204	6211	50 %	25 %	25 %	0 %	116628688
118	NC_008530	AGG	2	6	6333	6338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628688
119	NC_008530	CGT	2	6	6492	6497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628689
120	NC_008530	TTG	2	6	6562	6567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628689
121	NC_008530	CTC	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628689
122	NC_008530	ATG	2	6	6802	6807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
123	NC_008530	ACTT	2	8	6850	6857	25 %	50 %	0 %	25 %	116628689
124	NC_008530	GAC	2	6	6890	6895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628689
125	NC_008530	CCA	2	6	6903	6908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628689
126	NC_008530	TAC	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628689
127	NC_008530	GGC	2	6	7035	7040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116628689
128	NC_008530	AGGTAA	2	12	7061	7072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116628689
129	NC_008530	GTT	2	6	7077	7082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628689
130	NC_008530	TAGT	2	8	7132	7139	25 %	50 %	25 %	0 %	116628689
131	NC_008530	A	6	6	7201	7206	100 %	0 %	0 %	0 %	116628689
132	NC_008530	TGA	2	6	7232	7237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
133	NC_008530	CAGAC	2	10	7240	7249	40 %	0 %	20 %	40 %	116628689
134	NC_008530	CTT	2	6	7382	7387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628689
135	NC_008530	AAG	2	6	7426	7431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628689
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